MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011981	GCG	2	6	592642	592647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102907
10002	NC_011981	TGG	2	6	592695	592700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102907
10003	NC_011981	GGC	2	6	592909	592914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102907
10004	NC_011981	GGC	2	6	592998	593003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102907
10005	NC_011981	CCTGC	2	10	593008	593017	0 %	20 %	20 %	60 %	222102907
10006	NC_011981	CAC	2	6	593078	593083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102908
10007	NC_011981	CAC	2	6	593141	593146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102908
10008	NC_011981	ATG	2	6	593200	593205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102908
10009	NC_011981	CCTTTC	2	12	593233	593244	0 %	50 %	0 %	50 %	222102908
10010	NC_011981	GCC	2	6	593321	593326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102908
10011	NC_011981	TGG	2	6	593328	593333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102908
10012	NC_011981	CCA	2	6	593377	593382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102908
10013	NC_011981	GCA	2	6	593446	593451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102908
10014	NC_011981	CGT	2	6	593452	593457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102908
10015	NC_011981	TCC	2	6	593547	593552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102908
10016	NC_011981	GCC	2	6	593567	593572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102908
10017	NC_011981	GAA	2	6	593664	593669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102908
10018	NC_011981	TCC	2	6	593703	593708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102908
10019	NC_011981	GTG	2	6	593799	593804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102908
10020	NC_011981	GCC	2	6	593810	593815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102908
10021	NC_011981	ATTGAC	2	12	593886	593897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222102908
10022	NC_011981	CCA	2	6	594043	594048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102908
10023	NC_011981	GAT	2	6	594074	594079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102909
10024	NC_011981	TG	3	6	594130	594135	0 %	50 %	50 %	0 %	222102909
10025	NC_011981	GATG	2	8	594149	594156	25 %	25 %	50 %	0 %	222102909
10026	NC_011981	ATG	2	6	594207	594212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102909
10027	NC_011981	GC	3	6	594256	594261	0 %	0 %	50 %	50 %	222102909
10028	NC_011981	GCC	2	6	594292	594297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102909
10029	NC_011981	CAG	2	6	594313	594318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102909
10030	NC_011981	GCC	2	6	594369	594374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102909
10031	NC_011981	CGC	2	6	594410	594415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102909
10032	NC_011981	ATT	2	6	594492	594497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102909
10033	NC_011981	GACGCT	2	12	594554	594565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222102909
10034	NC_011981	ATG	2	6	594586	594591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102909
10035	NC_011981	CG	3	6	594610	594615	0 %	0 %	50 %	50 %	222102909
10036	NC_011981	TCA	2	6	594631	594636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102909
10037	NC_011981	GAA	2	6	594639	594644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102909
10038	NC_011981	GC	3	6	594653	594658	0 %	0 %	50 %	50 %	222102909
10039	NC_011981	CAC	2	6	594692	594697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102909
10040	NC_011981	GCCC	2	8	594722	594729	0 %	0 %	25 %	75 %	222102909
10041	NC_011981	TTCCGC	2	12	594944	594955	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222102910
10042	NC_011981	GCC	2	6	594984	594989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102910
10043	NC_011981	GCTG	2	8	595076	595083	0 %	25 %	50 %	25 %	222102910
10044	NC_011981	CCG	2	6	595098	595103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102910
10045	NC_011981	GC	3	6	595124	595129	0 %	0 %	50 %	50 %	222102910
10046	NC_011981	TTG	2	6	595186	595191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102910
10047	NC_011981	GGT	2	6	595197	595202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102910
10048	NC_011981	CGA	2	6	595250	595255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10049	NC_011981	GTG	2	6	595257	595262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102910
10050	NC_011981	GCA	2	6	595340	595345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10051	NC_011981	GC	3	6	595361	595366	0 %	0 %	50 %	50 %	222102910
10052	NC_011981	GGC	2	6	595379	595384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102910
10053	NC_011981	CAA	2	6	595424	595429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102910
10054	NC_011981	GCC	2	6	595440	595445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102910
10055	NC_011981	TGC	2	6	595483	595488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10056	NC_011981	CGA	2	6	595514	595519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10057	NC_011981	ACG	2	6	595540	595545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10058	NC_011981	TCA	2	6	595675	595680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102910
10059	NC_011981	CCA	2	6	595723	595728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102910
10060	NC_011981	CGT	2	6	595806	595811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10061	NC_011981	GC	3	6	595850	595855	0 %	0 %	50 %	50 %	222102910
10062	NC_011981	ACC	2	6	595914	595919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102910
10063	NC_011981	ACG	2	6	595942	595947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10064	NC_011981	TGAT	2	8	595966	595973	25 %	50 %	25 %	0 %	222102910
10065	NC_011981	AGC	2	6	595975	595980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102910
10066	NC_011981	CTT	2	6	596021	596026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102910
10067	NC_011981	CCA	2	6	596041	596046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102910
10068	NC_011981	TTC	2	6	596177	596182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102911
10069	NC_011981	GCA	2	6	596199	596204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10070	NC_011981	AC	3	6	596253	596258	50 %	0 %	0 %	50 %	222102911
10071	NC_011981	TTC	2	6	596272	596277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102911
10072	NC_011981	GCG	2	6	596283	596288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102911
10073	NC_011981	GAT	2	6	596302	596307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102911
10074	NC_011981	GCT	2	6	596311	596316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10075	NC_011981	ACTG	2	8	596377	596384	25 %	25 %	25 %	25 %	222102911
10076	NC_011981	CACGG	2	10	596461	596470	20 %	0 %	40 %	40 %	222102911
10077	NC_011981	CGG	3	9	596485	596493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102911
10078	NC_011981	CAG	2	6	596494	596499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10079	NC_011981	CCA	2	6	596571	596576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102911
10080	NC_011981	GAAA	2	8	596577	596584	75 %	0 %	25 %	0 %	222102911
10081	NC_011981	TTG	2	6	596657	596662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102911
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10083	NC_011981	GCA	2	6	596709	596714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10084	NC_011981	GCT	2	6	596773	596778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10085	NC_011981	CCCG	2	8	596802	596809	0 %	0 %	25 %	75 %	222102911
10086	NC_011981	ATC	2	6	596867	596872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102911
10087	NC_011981	GC	3	6	596892	596897	0 %	0 %	50 %	50 %	222102911
10088	NC_011981	TCA	2	6	596907	596912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102911
10089	NC_011981	GCTG	2	8	596922	596929	0 %	25 %	50 %	25 %	222102911
10090	NC_011981	GCA	2	6	596931	596936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10091	NC_011981	TTC	2	6	596956	596961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102911
10092	NC_011981	TGC	2	6	597027	597032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102911
10093	NC_011981	TCC	2	6	597360	597365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102912
10094	NC_011981	GTG	2	6	597433	597438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102912
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10098	NC_011981	AGA	2	6	597593	597598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102912
10099	NC_011981	CTG	2	6	597612	597617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102912
10100	NC_011981	TGG	2	6	597673	597678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102912
10101	NC_011981	CG	3	6	597679	597684	0 %	0 %	50 %	50 %	222102912
10102	NC_011981	CATC	2	8	597709	597716	25 %	25 %	0 %	50 %	222102912
10103	NC_011981	TCC	2	6	597744	597749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102912
10104	NC_011981	TGA	2	6	597881	597886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102912
10105	NC_011981	GGA	2	6	598052	598057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102912
10106	NC_011981	TC	3	6	598081	598086	0 %	50 %	0 %	50 %	222102913
10107	NC_011981	TGC	3	9	598119	598127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102913
10108	NC_011981	CTG	2	6	598196	598201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102913
10109	NC_011981	TC	3	6	598492	598497	0 %	50 %	0 %	50 %	222102913
10110	NC_011981	TGA	2	6	598512	598517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102913
10111	NC_011981	ATCA	2	8	598553	598560	50 %	25 %	0 %	25 %	222102913
10112	NC_011981	CAG	2	6	598582	598587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102913
10113	NC_011981	TTG	3	9	598596	598604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102913
10114	NC_011981	CTG	2	6	598706	598711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102913
10115	NC_011981	GGC	2	6	598721	598726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102913
10116	NC_011981	CAT	2	6	598782	598787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102914
10117	NC_011981	TGT	2	6	598814	598819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102914
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10119	NC_011981	CGCTG	2	10	598949	598958	0 %	20 %	40 %	40 %	222102914
10120	NC_011981	GCT	2	6	599037	599042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102914
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10122	NC_011981	GCT	2	6	599102	599107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102914
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10143	NC_011981	TGA	2	6	600103	600108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102915
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10230	NC_011981	GGAAT	2	10	604790	604799	40 %	20 %	40 %	0 %	222102921
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10234	NC_011981	GCCA	2	8	604925	604932	25 %	0 %	25 %	50 %	222102921
10235	NC_011981	ATGA	2	8	604942	604949	50 %	25 %	25 %	0 %	222102921
10236	NC_011981	CAT	2	6	605010	605015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102921
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10238	NC_011981	ACC	2	6	605119	605124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102921
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10359	NC_011981	CCCT	2	8	613335	613342	0 %	25 %	0 %	75 %	222102927
10360	NC_011981	ATG	2	6	613354	613359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102927
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10365	NC_011981	GCCC	2	8	613870	613877	0 %	0 %	25 %	75 %	222102928
10366	NC_011981	GCC	2	6	613955	613960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102928
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10371	NC_011981	CCT	2	6	614070	614075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102928
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10386	NC_011981	CGCA	2	8	614803	614810	25 %	0 %	25 %	50 %	222102928
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10478	NC_011981	GAA	2	6	620560	620565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102933
10479	NC_011981	GC	3	6	620572	620577	0 %	0 %	50 %	50 %	222102933
10480	NC_011981	TGC	2	6	620587	620592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102933
10481	NC_011981	CGA	2	6	620668	620673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102933
10482	NC_011981	TCT	2	6	620691	620696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102933
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